有爱丽丝的存在，他们是不可能有机会离开这里的，艾萨克还需要实验数据呢！
果不其然，在他说完这些话之后的几分钟里，就在这些雇佣兵还在思考着是否应该相信他的话语离开时，外面传来了爆炸声！
“轰！”轰鸣声响彻全场，那两架直升机连带着他们的驾驶员，变成了燃烧的火焰和散碎的尸体！
“看起来，有人不愿意你们离开这里！”庄泉一摊手，他就知道，那个自认为幕后黑手的克隆艾萨克现在正从一个摄像头里看向自己，他的第二个理由就是说给对方听的。
“彼得，你去看看外面的情况，恐怕不仅仅是爆炸这么简单！”庄泉吩咐，“哈利，注意警戒，你应该知道我们会遇到的危机！”
“我知道你在看，艾萨克，但是作为一个克隆体，我们没什么好聊的，也许，我会愿意和你的本体，好好的聊一聊！”庄泉对着一个摄像头，竖起一根手指放在嘴边，“当然，这件事情，也许你的本体也知道呢？”
“至于这个基地的事情，或许我们也可以聊聊，红皇后？”
他对着摄像头后面的两个人，轻轻的说道。
这次的事件，看起来是一场伪装的很好的意外，也是天启计划启动的预兆。
实际上，这是幕后主使的艾萨克和红皇后背后的那两位，也就是真正的艾萨克博士和爱丽丝的母体艾丽西亚，在蜂巢的一次短暂交锋！
艾丽西亚的父亲，也就是詹姆斯·马库斯博士，他为了治好自己女儿的早衰症，研究出了能够使得人体细胞恢复和增长的T病毒项目。
但是在一场意外中，马库斯发现继续使用这种病毒会让人变成丧尸，于是他终止了实验，并且想要彻底关闭T病毒的项目。
只可惜，他的合伙人艾萨克博士并不希望他这么干，找来威斯克杀死了马库斯，借故成为了艾丽西亚的监护人，并且开始逐步推行克隆人以及毁灭世界的病毒扩散计划，也就是——天启计划！
但是艾丽西亚并不同意他的想法，并且依靠着自己超额的权限，在马库斯制作的超级人工智能“红后”的核心指令集里，植入了另外一条指令！
为了能让自己在永恒的沉眠后醒来依然可以掌控公司，并且在睡觉时，天启计划依然可以推行，艾萨克创造了红后，并且在红后的指令中，写下了第一条就是服务好保护伞公司的指令。
但是作为一名已经成年的大股东，艾丽西亚有着完备的权利，她在指令中下了第二个命令，即保护好人类！
所以电影中那个带着矛盾和怪异的红皇后，就这样出现在众人眼前。
而因为红皇后的灭绝命令导致出现了天启计划的漏洞，也让克隆艾萨克博士，派遣了特殊小队USF，也就是詹姆斯这只队伍，进入蜂巢，关闭红后，彻底释
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